Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pacsin3Q99JB8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pacsin3Q99JB8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pacsin3Q99JB8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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