Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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