Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms