Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms