Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms