Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms