Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms