Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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