Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubxn4Q8VCH8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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