Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nup58Q8R332 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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