Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Afg3l2Q8JZQ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms