Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr2bQ8CFI7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr2bQ8CFI7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms