Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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