Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms