Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcinQ8CDE2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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