Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms