Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ccdc187Q8C5V8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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