Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pnma1Q8C1C8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnma1Q8C1C8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma1Q8C1C8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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