Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atg16l1Q8C0J2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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