Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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