Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm4aQ8BW72 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4aQ8BW72 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4aQ8BW72 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4aQ8BW72 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kdm4aQ8BW72 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kdm4aQ8BW72 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kdm4aQ8BW72 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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