Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms