Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms