Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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