Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smarcal1Q8BJL0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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