Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms