Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms