Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms