Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms