Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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