Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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