Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rexo1Q7TT28 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rexo1Q7TT28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rexo1Q7TT28 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms