Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms