Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms