Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sys1Q78S06 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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