Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rph3alQ768S4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rph3alQ768S4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rph3alQ768S4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rph3alQ768S4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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