Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SynmQ70IV5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms