Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms