Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms