Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms