Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms