Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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