Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt39Q6IFX4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt39Q6IFX4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Krt39Q6IFX4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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