Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkp4Q68FH0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkp4Q68FH0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkp4Q68FH0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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