Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms