Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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