Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms