Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms