Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms