Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms